Au XVIIe siècle, l’abbaye est dans un très mauvais état.
Les travaux les plus importants seront réalisés au XVIIIe, entre 1763 et 1771, sous la direction du prieur François Henin, ainsi que la démolition d’un grand nombre de bâtiments jugés trop vétustes. L’abbaye se présente alors à peu près telle que nous la connaissons actuellement, sans pont-levis ni fossés.
Le mobilier et les bâtiments sont vendus. Les quelque 800 ouvrages qui composaient la bibliothèque sont expédiés à Civray, dont il ne reste de nos jours que trois liasses aux Archives départementales de la Vienne. Le lutrin se retrouve dans le chœur de Notre-Dame-la-Grande à Poitiers. Les cloches sont à Saint-Martin-l’Ars et à Genouillé.
